戰略與規劃研究室（簡稱“戰規室”）開展海洋觀測、調查、監測技術與裝備發展戰略以及國際合作政策研究，擬訂相關規劃、政策制度。開展業務化技術裝備體系研究。承擔國家全球海洋立體觀測網及海洋觀測重大工程的總體論證和頂層設計工作，承擔海洋環境保障相關規劃和政策研究，承擔極地發展研究。承擔參加國際海洋觀測組織和計劃相關工作。

 海洋觀測網運行監控中心（簡稱“監控中心”）負責國家全球海洋立體觀測網運行狀態監控系統的建設、運行和管理。負責觀測網運行狀態質量分析和評價，編制觀測網運行報告。

岸基觀測部（簡稱“岸基部”）負責岸基海洋觀測站點的建設規劃、代表性評估、規范化設計、巡檢維護、技術培訓等保障工作，擬定相關技術標準。負責海外站、極地海洋站、海上平臺站等的建設和技術保障。

離岸觀測部（簡稱“離岸部”）負責離岸海洋觀測站點的建設規劃、代表性評估、規范化設計、巡檢維護、技術培訓等保障工作，擬定相關技術標準。負責國際海洋觀測計劃實施技術支撐工作。負責海底觀測系統的技術設計、系統集成、運行保障等工作。

船舶觀測部（簡稱“船舶部”）負責部海洋船舶及其搭載裝備的規劃、建設和管理的支撐工作，擬定相關技術標準。負責海洋志愿觀測的支撐和保障。負責國家海洋調查船隊運行管理技術保障，建設運行國家海洋調查船隊信息服務平臺和部海洋船舶監控管理平臺。

 

航空觀測部（簡稱“航空部”）負責航空和衛星遙感器定標檢驗、數據應用的技術研究和支撐，負責海洋無人機觀監測業務體系的規劃、建設和管理的支撐工作，開展海洋測繪裝備規劃論證工作，承擔海洋光學調查和海洋測繪任務。

 

海洋能發展中心（簡稱“海洋能中心”）開展海洋能發展戰略研究，擬訂技術和產業發展規劃、政策制度。負責海洋能產業運行監測評估，編制產業發展報告。負責海洋能資源調查與評估、資源區劃工作。負責海洋能產業公共服務平臺的建設、運行和管理。參與海洋能國際組織，承擔相關國際公約、條約、協定的磋商和履約的支撐工作。

 

海洋能項目管理辦公室（簡稱“海洋能項目辦”）負責國家海洋能項目的策劃、立項、監管和驗收等支撐工作。

 

海洋試驗場管理中心（海洋能測試評價中心）（簡稱“試驗場中心”）負責海洋觀測監測調查和海洋能開發利用技術與裝備的測試評估工作，負責質量檢驗、計量及相關資質運行工作。承擔海域使用和海洋能標準化分技術委員會相關工作。負責國家海洋試驗場的建設和運行。

 

海洋環境保障部（簡稱“海保部”）負責海洋環境保障標準規范研究，承擔海洋環境保障體系論證和系統集成，開展海洋環境信息獲取技術與裝備創新，承擔海洋環境保障技術支持與服務。

 

海洋裝備技術研究院（簡稱“裝備研究院”）開展岸海空天海洋觀測、海洋能開發利用、海洋生態監測修復前沿與關鍵技術裝備研制及成果轉化，開展國際交流和合作。負責海洋觀測實驗室建設運行。

 

海洋資源保護利用研究院（簡稱“資源保護研究院”）承擔海洋資源調查監測評價任務，負責海洋生態修復政策、標準規范研究和擬定工作，開展海洋生態環境監測、修復及相關技術研究，開展海洋資源開發利用技術咨詢服務和國際合作工作。